單細胞測序發(fā)現新的免疫前體細胞
CD4+輔助性T細胞通常在免疫反應中扮演中間角色,協(xié)助產生其他類型的免疫細胞。不過,據《Science Immunology》報道,在某些情況下,比如存在慢性病毒感染,一部分的CD4+輔助性T細胞會變成細胞毒性T細胞(CD4-CTL)。
La Jolla過敏與免疫研究所等機構的研究人員對9,000多個CD4+ T細胞開展單細胞RNA測序,這些細胞來自世界各地的捐獻者,包括斯里蘭卡和尼加拉瓜。他們發(fā)現,CD4-CTL來源于一部分稱為CD4-TEMRA的T細胞。
研究人員從健康的成人捐獻者中采集血樣,并分離出外周血單個核細胞,這不僅包括T細胞,還包括B細胞、NK細胞和單核細胞。之后,他們進行細胞分選,并分離出T細胞進行RNA測序。
一些獻血者之前曾受登革熱病毒或人巨細胞病毒的感染,這兩種病毒都會影響CD4-CTL。對于三名曾經感染登革熱病毒的獻血者,研究人員比較了CD45RA(TEMRA)、效應記憶T細胞(TEM)和中央記憶T細胞(TCM)中CD4+ T細胞的全長轉錄組。
研究人員發(fā)現,登革熱感染者的TEMRA亞群中富含111個轉錄本。他們指出,許多轉錄本,如GZMB、SPON2和CX3CR1,與CD8+ T淋巴細胞和自然殺傷細胞的細胞毒性能力有關,而另一些轉錄本編碼與CTL功能相關的轉錄因子,如ZNF683和TBX21。這確認了TEMRA細胞富含CD4-CTL。
通過比較單細胞和大量細胞的T細胞抗原受體庫,研究人員發(fā)現與TEM和TCM細胞相比,TEMRA細胞亞群表現出更大的克隆擴增。此外,通過比較各個人群CD4-CTL的克隆性和轉錄組,他們也發(fā)現CD4-TEMRA細胞之間是高度異質的。
之后,利用聚類軟件,研究人員發(fā)現CD4-TEMRA細胞可以分成四個亞組。通過分析和比較轉錄組,他們發(fā)現兩個亞組可能包含CD4-CTL效應物,而另外兩個亞組似乎是它們的記憶前體細胞。1和2的特征是高水平的KLRG1和低水平的IL-7R,而3和4的特征是低水平的KLRG1和高水平的IL-7R。
研究人員認為,更好地了解CD4-CTL前體將有助于改善疫苗的免疫應答。人們可開發(fā)一些策略,以促進病毒感染和癌癥后的疫苗接種有持續(xù)的CD4-CTL免疫應答。

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