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環肽藥物作為醫藥領域的一顆冉冉升起的新星,其獨特的結構和卓越的功能引起了全球科研人員的廣泛關注。這些環狀分子以其高穩定性和選擇性,為治療多種疾病提供了新的治療策略。在環肽藥物的研究中,基因編碼展示技術和mRNA display技術發揮了重要作用。
mRNA display技術的應用范圍廣泛,不僅包括多肽和蛋白質適體的發現,還涵蓋了蛋白質相互作用機制的深入闡明和分析,為環肽藥物的研究提供了強有力的技術支持。
美迪西云講堂邀請生物部高級研究員/項目經理劉超博士為您解答環肽藥物研發中常見的問題,一起看看吧!
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1 篩選獲得的大環肽有重復的序列嗎?
劉超博士:確實存在這樣的情況。在我們的測序分析中,我們發現了一些重復的序列。有時,這些重復可能意味著某個序列被多次篩選出來,導致拷貝數增加。可能有三個或四個序列指向同一個大環肽。對于這些具有相同序列的情況,我們將在后續的SPR驗證或合成過程中給予重點關注。
2 如果可以提供靶點蛋白,我必須攜帶列出來的GST或者Fc標簽嗎?是否能換成其他的純化標簽嗎?
劉超博士:可以通過下圖看到文庫的基本信息,環肽本身帶有His標簽的,標簽是為了輔助環肽的提純過程,除了His標簽之外,其他各種標簽也可用于靶點蛋白的純化。這些靶點蛋白上的標簽的關鍵作用是固定靶點蛋白,確保其在實驗過程中的穩定地固定在beads上。
3 想問一下mRNA的環肽展示技術可以和生物合成相結合?利用植物中的環化酶去環化?
劉超博士:可以的,環化酶是通過兩個環肽,類似直播中提到的半胱氨酸成環的。在我們實驗室,環化是通過化學方法進行的,確保了環肽的完整性和功能性。環化完成后,我們會進行純化步驟,以確保獲得的環肽是完整且可以順利結合的。這一純化過程對于保證環肽的質量和活性至關重要,確保了我們能夠提供高質量的環肽產品。
4 你們如何進行QC檢測的?
劉超博士:我們采用的是高通量測序技術,目前還在開發LC-MS的方法。在實驗的早期階段,我們通過銀染技術進行定性分析,以確保翻譯過程中多肽的生成和翻譯的順利進行。在mRNA/cDNA與大環肽共軛物階段,我們利用二代高通量測序技術,這有助于在篩選前確保文庫的質量,并提供更準確可靠的數據。
5 請問通常mRNA篩選一輪需要多久?
劉超博士:從DNA文庫到完成篩選和測序的整個流程,我們預計需要大約5至6周的時間。這個時間框架主要是由于文庫測序階段相對較長,大約需要兩周左右。實際上,如果只考慮操作過程,完整的操作可以在兩周內完成。
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