近日，刊登在國際著名雜志Cell上的一項研究報告中，來自紐約大學醫學中心（NYU Langone Medical Center）的科學家通過對乳腺癌細胞功能的大量分析，揭示了當前許多藥物的新用途，以及用于藥物開發和組合性藥物開發的新靶點。

同時也可以幫助科學家們尋找其它種類癌癥的新型候選藥物，為揭示癌癥耐藥性的產生也提供了新的思路。

相比以往研究而言，本文研究中研究人員對多種類型的乳腺癌細胞進行了組合性的遺傳分析，Benjamin Neel博士表示，這項研究闡述了一種新的研究思路，即揭示了乳腺癌細胞的遺傳改變如何干擾對癌細胞生長和生存關鍵的通路，而這種通路或許可以被當前存在的多種藥物的組合進行靶向作用。研究者利用新型的統計學方法對早期技術進行了改進，其可以幫助鑒別出對特殊乳腺癌亞型非常關鍵的多種基因，比如HER2、雌激素受體/ER、HER3等。
這項研究中，研究人員對77份乳腺癌細胞系進行了shRNA的篩查研究，而這些樣本的研究足以闡述多種乳腺癌亞型，隨后研究者利用新型的統計學技術，即si/shRNA混合效應模型（siMEM）技術，來對細胞系基因敲除研究進行評分，最終鑒別出對癌癥生長重要的候選基因；同時研究者還可以將研究結果同癌癥遺傳數據庫的信息進行對比。
聯合方法的應用可以將其同對癌癥特性的研究聯系起來，從而進行假陽性率更低的篩查工作，文章中研究者就鑒別出了一系列候選基因，而他們并不知道這些基因在乳腺癌細胞的生存上扮演的重要角色，此外研究者還發現細胞需要的一系列基因對90種抗癌藥物具有敏感性或耐藥性。
當新方法可以揭示每一種類型乳腺癌的特殊信號通路時，研究者就選擇了一種進行額外的分析，來揭示這項工作的潛力；研究人員認為BRD4或許可以作為一種對HER2+癌細胞及三陰性乳腺癌細胞生存非常必要的基因；BRD4是BET家族的成員（BET家族：布羅莫結構域和額外的末端結構域），其可以幫助調節對細胞生長非常重要的基因，而且BET抑制劑藥物的靶點也可以用于當前白血病的臨床試驗中。BET抑制劑或可用于治療多種乳腺癌，而對這些藥物耐受性或許可以被編碼磷脂酰肌醇3-激酶的基因的突變所影響，而且這種耐藥性可以通過將藥物依維莫司同BET抑制劑進行結合來抵消。
最后研究者Neel表示，目前很少有患者進行了癌細胞的全基因組測序分析，而且也并沒有因測序的結果而獲益；而我們的最終目的就是理解每一種癌細胞的“電路圖”來闡明新型的癌細胞分子靶點，從而為開發新型藥物療法提供新的思路和線索。