一些公司推出了臨床研究管理系統的服務（Clinical Trial Management System）。這個系統在大型的國際性CRO公司很常見，但內資CRO公司都還沒有。所謂臨床研究管理系統，是CRA或者臨床研究助理將臨床研究的所有信息，包括監查報告都輸入到系統中。這樣不但便于項目經理對項目進行質量控制，同時，由于申辦方可以給予相應的權限進入到系統之中，在臨床研究期間，申辦方的人員也可以直接通過臨床研究管理系統參與項目管理。一家CRO公司是否有臨床研究管理系統，是CRO公司實力的一個標志。現在一些國內軟件公司開始涉足這一領域，為國內的CRO提供相應的服務。