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美問必答 | 基因毒性雜質(zhì)破解法,你了解了嗎?

2024-06-13
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基因毒性雜質(zhì)是指可能對生物體細胞的遺傳物質(zhì)(DNA或RNA)造成損害的化合物或物質(zhì)。這些雜質(zhì)可能導致基因突變、染色體畸變、DNA斷裂等不良影響,進而影響細胞的正常功能和生長,甚至引發(fā)癌癥等疾病。近年對基因毒性雜質(zhì)的重視持續(xù)提升,引發(fā)了更多關于基因毒性雜質(zhì)的研究和探討。在新藥研發(fā)的過程中,基因毒性雜質(zhì)是我們不得不面對一個重要的問題。對其進行充分的研究和評估至關重要,可以保障患者安全,提高藥物品質(zhì),符合監(jiān)管要求,是新藥研發(fā)中的關鍵步驟之一。

點擊鏈接“http://www.zd69.cn/video/genotoxic-impurities.shtml,回顧畢增老師精彩直播!

美迪西服務-基因毒性雜質(zhì)研究.jpg

01 可以用mini-Ames 試驗代替Ames試驗嗎?

畢增:按照我們的經(jīng)驗,在IND申報階段,雜質(zhì)使用mini-Ames試驗可作為正式Ames試驗的替代材料進行申報。然而,在新藥上市申報和仿制藥上市申報時應該采用標準Ames試驗,要注意M7(R2)的注釋2所說的微量化測試并不是指mini-Ames試驗,是指待測化合物數(shù)量有限不能使用符合指導原則的試驗濃度時可以采取的措施。

02 仿制藥研發(fā),每個雜質(zhì)都需要進行軟件評估嗎?

畢增:是的,M7(R2)問答中明確建議對所有雜質(zhì)進行模擬和評估。通過我直播中分享的案例,可以看到一些化合物,即使沒有基因毒性警示結(jié)構,也可能具有基因毒性。因此,即使某些化合物不在我們的警示結(jié)構列表中,仍需對其進行評估,因為它其實也是可能有基因毒性的。

03 如果有Ames試驗數(shù)據(jù),還需要進行軟件評估嗎?

畢增:需要根據(jù)情況而定。如果數(shù)據(jù)庫收錄的Ames試驗是不是符合OECD指導原則或ICH S2的標準Ames試驗,即是否使用了5種菌株,并且在有代謝激活和沒有代謝激活兩種途徑下都進行了實驗,并且試驗應該是符合GLP規(guī)范的,在滿足以上前提的情況下,Ames試驗Negative,那么就無需進行軟件評估,但是需要進行比較全面的數(shù)據(jù)庫檢索。

04 是在藥品研發(fā)的哪個階段評估呢?

畢增:根據(jù)我的理解,需要根據(jù)每個項目的具體情況進行分析。我的建議是,在工藝穩(wěn)定后,例如工藝路線已經(jīng)確定并且優(yōu)化工作已經(jīng)完成后,在小試生產(chǎn)階段同步開展評估。在這個階段,通常不會對之前的工藝進行大幅調(diào)整,除非在后續(xù)放大過程中發(fā)現(xiàn)了一些問題,例如放大效應導致雜質(zhì)超標或者收率較大幅度的。一般情況下,建議在小試驗階段進行相應的評估。這樣可以提前進行方法開發(fā)和簡單確認工作,并且隨著逐步放大的過程,積累數(shù)據(jù),為后續(xù)的雜質(zhì)控制策略提供數(shù)據(jù)支持。

05 Case ultra 預測合規(guī)嗎?CDE老師認可代替AMES實驗嗎?

畢增:這個是合規(guī)的,可以放心。因為我們完成的多個仿制藥項目,包括新藥的IND申報,還是客戶委托完成的發(fā)補的雜質(zhì)預測,都有使用 Case ultra進行預測,都是沒有問題的。

Case ultra有Statistical Model(GT1_BMUT)統(tǒng)計學模型,該模型是通過RCA協(xié)議與美國FDA合作開發(fā)和驗證的模型,訓練集中包含13760個化合物;同時有Expert Rule Model(GT_EXPERT)專家規(guī)則模型,參考數(shù)據(jù)集中有17309個化合物作為參考數(shù)據(jù)集用于驗證規(guī)則。警示結(jié)構的數(shù)量有240個,包含普通的陽性警示結(jié)構,陽性減弱和陽性增強的子類型以及全局的陽性減弱的警示結(jié)構。

Case ultra可以滿足ICH M7同時使用兩種模型對化合物進行預測的要求,并且所有的模型都是進行過嚴格驗證的,可以查看后臺數(shù)據(jù),可以查看警示結(jié)構和相關細節(jié),擁有明確的算法和良好的預測透明度,符合OECD的相關規(guī)則。

06 三氟甲磺酸那個案例中樣品本身就有三氟甲磺酸,這個水解方式還能行嗎?

畢增:這個案例是由于在方法開發(fā)初期,我們對API進行了三氟甲磺酸的檢測,并未檢出該雜質(zhì)?;谶@個結(jié)果,我采用這種檢測方法,如果樣品中本身就有三氟甲磺酸檢出,則會導致雜質(zhì)被高估,這種情況下可以檢測水解后生成的另一個片段,比如說在案例中的3-羥基-2-硝基吡啶。

07 雜質(zhì)的軟件評估都可以使用哪些軟件?

畢增:除了Case Ultra之外,Derek和Sarah也是同樣優(yōu)秀的商業(yè)預測軟件。當然,除了商業(yè)軟件外,也有一些免費的軟件,比如VEGA GUI,我個人使用過該軟件,預測的結(jié)果并不明確??赡苁且驗檐浖采w的的數(shù)據(jù)庫相對較小,覆蓋的化合物種類也有限,導致用于訓練軟件算法的化合物數(shù)量較少,從而影響了計算結(jié)果的可靠性,合規(guī)性方面有較大的挑戰(zhàn),大家使用這類軟件的時候還是要慎重一些。

08 臨床上單次使用的局部給藥制劑中有一個雜質(zhì)超過了界定限度,要做哪些安全性評價?

畢增:對于制劑中超過界定限度的雜質(zhì),建議按照ICH Q3B(R2)的附件3-降解產(chǎn)物鑒定和界定決策樹進行研究,首先要確定該雜質(zhì)是否能降低至小于等于界定限,如果不能的話則考慮根據(jù)患者人群、用藥時間進行以下研究:致突變性研究(點突變、染色體畸變)、一般毒性研究(單個種類,通常14至90天)或者酌情考慮是否開展其他的毒性終點試驗。

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