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美迪西專訪 | 新藥研發(fā)智在必行:聽任峰博士暢談AI制藥的無畏前行

2024-06-13
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在人工智能的迅猛發(fā)展趨勢下,AI在藥物研發(fā)領(lǐng)域的應(yīng)用正逐漸改變傳統(tǒng)醫(yī)藥產(chǎn)業(yè)格局,推動著藥物研發(fā)朝著更快、更強、更精準的方向積極變革。英矽智能作為AI制藥領(lǐng)域的佼佼者,在過去幾年表現(xiàn)搶眼,無論是管線建設(shè)、平臺技術(shù)還是出海合作,都展現(xiàn)了其超強的實力。

AI制藥是否最終能引領(lǐng)新藥研發(fā)取得成功?它是否能通過算法數(shù)據(jù)等方式有效加速藥物研發(fā)進程?美迪西作為英矽智能的合作伙伴,有幸邀請英矽智能聯(lián)合首席執(zhí)行官兼首席科學(xué)官任峰博士,和大家一起探討和解讀人工智能在新藥研發(fā)的發(fā)展和趨勢。

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任峰 博士,英矽智能聯(lián)合首席執(zhí)行官兼首席科學(xué)官,畢業(yè)于美國哈佛大學(xué)化學(xué)系,擁有超過15年藥物研發(fā)行業(yè)經(jīng)驗。曾任跨國藥企葛蘭素史克的小分子創(chuàng)新藥物研發(fā)負責(zé)人,2018年加入上海美迪西,歷任副總裁、高級副總裁,全面負責(zé)化學(xué)部和生物部的研發(fā)服務(wù)業(yè)務(wù)以及公司的藥物發(fā)現(xiàn)平臺服務(wù)業(yè)務(wù)。
2021年加入英矽智能任首席科學(xué)官,帶領(lǐng)藥物研發(fā)團隊利用公司自主研發(fā)的人工智能平臺構(gòu)建臨床前/臨床產(chǎn)品管線和外部項目合作。2022年6月,任峰博士被任命為英矽智能聯(lián)合首席執(zhí)行官。任峰博士發(fā)表國際學(xué)術(shù)論文30余篇、國際專利20余件。
近日,國家藥監(jiān)局藥品審評中心(CDE)官網(wǎng)公示,英矽智能開發(fā)的1類新藥ISM3412獲得臨床試驗?zāi)驹S可在中國開展臨床試驗,適應(yīng)癥為晚期/轉(zhuǎn)移性實體瘤。ISM3412項目也是一款中美雙報的抗腫瘤項目,已于2024年4月獲得美國食品藥品監(jiān)督管理局(FDA)批準在美國開展臨床試驗,用于治療MTAP缺失癌癥。

ISM3412是英矽智能自2022年以來,第7款獲得臨床試驗批件的小分子藥物。這是一款靶向MAT2A的潛在同類最佳口服小分子抑制劑,也是英矽智能在“合成致死”策略下推進的又一個抗腫瘤管線。

Q1 美迪西:MAT2A小分子抑制劑具有哪些優(yōu)勢?能夠解決目前腫瘤治療中的哪些痛點?

任峰博士:MTAP缺失在腫瘤中的發(fā)生概率高達15%,是肺癌、膀胱癌和胰腺癌等癌癥中最常見的基因缺失之一,與患者預(yù)后不良相關(guān)。通過靶向MAT2A,我們有望調(diào)控影響細胞功能和存活的關(guān)鍵分子,從而對MTAP缺失的癌細胞產(chǎn)生選擇性抗增殖作用。

ISM3412是由生成化學(xué)平臺Chemistry42輔助設(shè)計的一款口服小分子抑制劑,具有“同類最佳”潛力。從臨床前數(shù)據(jù)看,ISM3412表現(xiàn)出優(yōu)異的類藥性、低劑量下的強大藥效、良好的溶解性和滲透性,以及優(yōu)良的安全性特征。

另外,ISM3412不僅具有單藥治療潛力,在臨床前研究中也表現(xiàn)出了和化療等標(biāo)準療法聯(lián)用的協(xié)同作用。和已知的同靶點候選藥物相比, ISM3412具有更優(yōu)良的治療窗口,已有數(shù)據(jù)支持這款小分子在非小細胞肺癌、間皮瘤、食管癌、膀胱癌等疾病領(lǐng)域的潛力。

Q2 美迪西:英矽智能正在開發(fā)的管線建設(shè)有什么獨特之處?在未來幾年,可以預(yù)期英矽智能在研發(fā)管線方面有望迎來哪些里程碑進展?

任峰博士:自2021年以來,在人工智能平臺的支持下,我們內(nèi)部開發(fā)了30多條管線并提名了18個PCC,目前其中7個化合物拿到了臨床試驗批件,這些項目在纖維化、腫瘤、自免等相關(guān)疾病領(lǐng)域都有所涉及。

從合作項目來看,近期我們和復(fù)星醫(yī)藥合作的兩個項目都在穩(wěn)步推進中,其中臨床階段的QPCTL項目,是一個腫瘤項目,近期完成了首例患者給藥,另一個合成致死的項目,也收到了復(fù)星醫(yī)藥的認可,雙方認定提名項目的PCC,真正實現(xiàn)了在合作中交付成果。

從自研項目來看,今年以來我們已經(jīng)提名了KIF18A的PCC,這是一款潛在同類最佳,靶向染色體不穩(wěn)定的小分子抑制劑,有望用于治療 TP53 突變的晚期實體瘤。臨床方面,MAT2A項目完成IND-enabling的研究,先后在中國和美國拿到臨床試驗批件。我們的核心管線IPF項目也在近期完成了在中國的2a臨床試驗的全部患者入組,預(yù)計年內(nèi)就可以披露階段性的結(jié)果和數(shù)據(jù)。這些都是讓我們非常振奮的臨床前和臨床里程碑。

Q3 美迪西:英矽智能建立了豐富的管線,如何保持這種高強度的推進能力的?

任峰博士:我們目前聚焦的領(lǐng)域有兩個特點,一個是數(shù)據(jù)比較充足,可以充分展現(xiàn)人工智能挖掘線索和篩選潛在可能性的能力,是人工智能擅長的領(lǐng)域;另一個特點,我們目前選擇立項的項目靶點都相對新穎,這樣的項目不僅擁有較大的市場潛力避免同質(zhì)化競爭,而且也可以給一些還沒有療法的疾病,比如一些進展較快的惡性腫瘤領(lǐng)域等,帶來一些破局。

Q4 美迪西:您認為Pharma.AI,特別適合幫助什么樣的企業(yè)?企業(yè)在什么階段或者在面臨哪些困境的時候Pharma.AI可以最大程度的進行幫助和合作?

任峰博士:在ChatGPT等C端的AI應(yīng)用爆火之后,生成式人工智能和大語言模型(LLM)好像一夜之間飛進千行百業(yè),但其實這些技術(shù)在醫(yī)藥研發(fā)領(lǐng)域的應(yīng)用要早得多。2016年,英矽智能發(fā)布了領(lǐng)域第一篇采用生成對抗網(wǎng)絡(luò)(GAN)賦能創(chuàng)新小分子生成的論文,并在此基礎(chǔ)上進行上下游延展,搭建并驗證了端到端賦能藥物研發(fā)三大階段的Pharma.AI平臺,貫穿生物化學(xué)、臨床開發(fā)領(lǐng)域。

在依賴研發(fā)人員經(jīng)驗的傳統(tǒng)藥物研發(fā)領(lǐng)域,靶點內(nèi)卷、高成本低效率的困境持續(xù)存在。我自己在研發(fā)一線做了十幾年,對此深有感觸,而AI或許就是破局的利器。和人類不同,AI可以快速學(xué)習(xí),甚至沒有止境地不斷迭代進步,僅僅是英矽智能自有的數(shù)據(jù)庫就涵蓋超10億個數(shù)據(jù)點,比一位科學(xué)家一輩子能讀的文獻還要多。結(jié)合生成式人工智能、自然語言處理、Transformer等前沿AI技術(shù),我們期待AI能對藥物研發(fā)領(lǐng)域起到全方位的降本增效作用。

Q5 美迪西:作為AI 制藥領(lǐng)域的佼佼者,英矽智能的核心法寶人工智能平臺Pharma.AI是否還會在AI應(yīng)用的哪些方面持續(xù)探索或加強自身的優(yōu)勢?

任峰博士:Pharma.AI平臺和算法一直處在持續(xù)的拓展優(yōu)化之中,基本是幾個月一次小更新,半年一次大更新。目前,平臺涵蓋的算法有30多種,都是優(yōu)中選優(yōu)、多次測試的結(jié)果。去年11月,我們發(fā)布了Pharma.AI版本更新,不僅擴充了數(shù)據(jù)庫、細化了數(shù)據(jù)標(biāo)簽邏輯,還強化了采用自然語言處理的實時問答功能,并添加了ADMET性質(zhì)預(yù)測等功能應(yīng)用。未來,我們期待AI技術(shù)可以賦能除生物醫(yī)藥之外的更多領(lǐng)域,也正在綠色化學(xué)和新材料方面進行探索,并達成了國際合作。

Q6 美迪西:AI制藥領(lǐng)域的發(fā)展還處在初期階段,機遇和挑戰(zhàn)并存的,您認為目前我國在這條賽道競爭力如何?有哪些方面需要更加進步和提升的?

任峰博士:在AI制藥賽道,中國起步相對比較晚,大部分公司集中在2016-2018年左右成立,落后了幾年的時間。正是因為這個原因,海外AI制藥公司率先將藥物管線推進到2期臨床階段也并不奇怪。但是,依托國內(nèi)高質(zhì)量的尖端人才和集聚的生物醫(yī)藥資源優(yōu)勢,我們有可能,甚至已經(jīng)實現(xiàn)了彎道超車。舉例來說,英矽智能領(lǐng)先的抗纖維化小分子靶向AI發(fā)現(xiàn)的靶點,分子結(jié)構(gòu)由AI設(shè)計,已經(jīng)在去年6月完成了2期臨床試驗的首批患者用藥,成為了全球首款達到這一里程碑的真正的“AI藥物”。

Q7 美迪西:對您而言,您是否相信AI制藥會為醫(yī)藥研發(fā)行業(yè)帶來顛覆性的變化?或您是否設(shè)想未來人工智能在哪一方面會給藥物研發(fā)行業(yè)更多的助力?

任峰博士:我相信AI制藥的潛力。傳統(tǒng)的新藥研發(fā)靠人的知識、經(jīng)驗,這些到達一個巔峰后很難再突破。但AI不同,它沒有任何人為偏見,有時候還能給我們眼前一亮的驚喜,并且隨著數(shù)據(jù)量的增加AI會一直進步,甚至是無上限的進步。

目前人工智能為藥物研發(fā)的賦能主要集中在早期藥物發(fā)現(xiàn)階段,也就是我們說的臨床前的部分,包括靶點發(fā)現(xiàn)、分子設(shè)計、合成路線模擬、晶型鹽型預(yù)測、ADMET性質(zhì)預(yù)測等等。隨著數(shù)據(jù)的規(guī)范化和開發(fā)開放,我們可以期待看到AI在現(xiàn)在還不能賦能方面,比如毒理性質(zhì)的預(yù)測等發(fā)揮作用。在臨床階段,我們也可以期待AI在篩選入組患者,甚至承擔(dān)對照試驗組方面體現(xiàn)價值。

Q8 美迪西:對于AI制藥,整個行業(yè)以及投資人們的態(tài)度是持續(xù)在變化的,AI制藥概念從一開始受到資本的狂熱追捧目前更多投資者會趨于冷靜,這對于英矽智能的發(fā)展而言會有什么樣的挑戰(zhàn)?

任峰博士:盡管全球AI賦能在研藥物已有超100款,但總體來說,目前AI制藥還處在相對早期發(fā)展階段。大多集中在臨床1期階段,最快的也只是在臨床2期,尚無AI發(fā)現(xiàn)藥物獲批上市,AI制藥還未得到概念性驗證,行業(yè)對AI制藥抱有懷疑,投資趨于冷靜都是很正常的事。

我們認為,在AI真正完成全流程的驗證之前,開發(fā)適合自身的商業(yè)模式,是整個AI制藥賽道需要面對的最主要的挑戰(zhàn)。英矽智能也在不斷的探索,從軟件合作、藥物研發(fā)服務(wù)、到藥物管線對外授權(quán)。但再好的商業(yè)模式如果無法給公司帶來收益,最終也將難以支撐。

2023年英矽智能先后與Exelixis和美納里尼完成兩個項目的對外授權(quán)合作,獲得了大額的首付款和里程碑付款,使當(dāng)年的收入實現(xiàn)了顯著上升。以這個經(jīng)驗來看,我們認為管線對外授權(quán)可能是是公司實現(xiàn)自我造血較為重要的商業(yè)模式。

Q9 美迪西:您之前也在美迪西這樣的CRO行業(yè)工作過,CRO行業(yè)的工作經(jīng)歷對于您而言最大的收獲是什么?

任峰博士:CRO的這段經(jīng)歷對我的幫助很大,在GSK的十多年工作里,我主要是從事藥物化學(xué)相關(guān)的研發(fā)工作的。加入美迪西之后我先主導(dǎo)了化學(xué)部的研發(fā)服務(wù)工作,之后又接手了生物部的研發(fā)服務(wù)業(yè)務(wù),以及美迪西的藥物發(fā)現(xiàn)平臺服務(wù)業(yè)務(wù)。使我有機會接觸到早期藥物發(fā)現(xiàn)各個環(huán)節(jié),生物學(xué)、化學(xué)、CMC、毒理研究等等,對藥物發(fā)現(xiàn)的端到端流程有了全面直觀的了解和介入,這為我加入英矽智能推動臨床前藥物發(fā)現(xiàn)做了非常好的鋪墊。

除了對我個人能力的提升之外,因為美迪西的工作經(jīng)歷,使我充分了解和信任CRO的能力,在加入英矽智能之后也更適應(yīng)和CRO的廣泛合作。目前英矽智能和全球包括美迪西在內(nèi)的40多家CRO達成了不同領(lǐng)域的合作,我們的模式是利用人工智能平臺做虛擬篩選,然后由具有經(jīng)驗的生物學(xué)家和藥化學(xué)家做2-3輪的專家反饋,然后交由CRO做濕試驗驗證。廣泛的CRO合作網(wǎng)絡(luò),使我們能夠在輕資產(chǎn)的情況下快速、及時并高效的推進項目。

關(guān)于英矽智能

英矽智能是一家由生成式人工智能驅(qū)動的臨床階段生物醫(yī)藥科技公司,通過下一代人工智能系統(tǒng)連接生物學(xué)、化學(xué)和臨床試驗分析,利用深度生成模型、強化學(xué)習(xí)、轉(zhuǎn)換模型等現(xiàn)代機器學(xué)習(xí)技術(shù),構(gòu)建強大且高效的人工智能藥物研發(fā)平臺,識別全新靶點并生成具有特定屬性分子結(jié)構(gòu)的候選藥物。英矽智能聚焦癌癥、纖維化、免疫、中樞神經(jīng)系統(tǒng)疾病、衰老相關(guān)疾病等未被滿足醫(yī)療需求領(lǐng)域,推進并加速創(chuàng)新藥物研發(fā)。

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